Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fam193bQ3U2K0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms