Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Serac1Q3U213 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms