Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a5Q3U1J0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a5Q3U1J0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a5Q3U1J0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a5Q3U1J0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a5Q3U1J0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a5Q3U1J0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a5Q3U1J0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a5Q3U1J0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a5Q3U1J0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms