Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms