Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U1D9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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