Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srsf6Q3TWW8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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