Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms