Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms