Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Jmjd8Q3TA59 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms