Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Treml4Q3LRV9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Treml4Q3LRV9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms