Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cpne9Q1RLL3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cpne9Q1RLL3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne9Q1RLL3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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