Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdrd9Q14BI7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdrd9Q14BI7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms