Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Traf3ip1Q149C2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Traf3ip1Q149C2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms