Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Spatc1Q148B6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Spatc1Q148B6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Spatc1Q148B6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Spatc1Q148B6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Spatc1Q148B6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Spatc1Q148B6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spatc1Q148B6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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