Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tigd2Q0VBL1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms