Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc7a1Q09143 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc7a1Q09143 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms