Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms