Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kcnma1Q08460 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kcnma1Q08460 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms