Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calb2Q08331 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Calb2Q08331 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms