Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cntn3Q07409 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms