Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2Q07279 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nfe2Q07279 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nfe2Q07279 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nfe2Q07279 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nfe2Q07279 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nfe2Q07279 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms