Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah2Q06986 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms