Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Thbs3Q05895 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Thbs3Q05895 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Thbs3Q05895 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs3Q05895 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs3Q05895 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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