Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk18Q04899 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms