Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox9Q04887 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms