Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox8Q04886 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms