Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Smarcad1Q04692 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smarcad1Q04692 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms