Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smpd1Q04519 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms