Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RelaQ04207 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms