Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Kcnb1Q03717 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnb1Q03717 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms