Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl7Q03366 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl7Q03366 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms