Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Thbs2Q03350 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Thbs2Q03350 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms