Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms