Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NfiaQ02780 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms