Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GscQ02591 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GscQ02591 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GscQ02591 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GscQ02591 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms