Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1cQ01815 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna1cQ01815 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms