Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HmgcrQ01237 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms