Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2cQ01098 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms