Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjb2Q00977 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb2Q00977 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms