Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VegfaQ00731 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms