Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms