Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cry1P97784 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms