Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nbr1P97432 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms