Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mesp1P97309 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms