Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx1P82976 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbx1P82976 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms