Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms