Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Otx2P80206 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms