Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Otx1P80205 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Otx1P80205 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms