Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tp53bp1P70399 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tp53bp1P70399 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tp53bp1P70399 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tp53bp1P70399 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tp53bp1P70399 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tp53bp1P70399 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tp53bp1P70399 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tp53bp1P70399 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tp53bp1P70399 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tp53bp1P70399 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tp53bp1P70399 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tp53bp1P70399 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms