Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms